Data scientist en pathologie moléculaire diagnostique 80-100%

L'unité de pathologie moléculaire de la Département de pathologie et de pathologie moléculaire de l'University Hospital Zurich est une unité de premier plan pour les développements en médecine de précision, y compris la génomique tumorale et l'intégration de données multi-omiques. Les analyses diagnostiques incluent de nombreuses méthodes omiques modernes et des technologies de pointe : séquençage du génome complet, séquençage de l'ARN bulk, puce de méthylation, pathologie numérique, séquençage de panels. Nos scientifiques analysent les données brutes de ces essais pour créer des rapports diagnostiques, développer de nouvelles méthodes et soutenir des projets de recherche. Vos principales tâches <br /> • Analyse indépendante, contrôle de qualité et interprétation des données NGS et multi-omiques dans un cadre diagnostique • Développement, validation et mise en œuvre de pipelines bioinformatiques pour le diagnostic moléculaire de routine • Analyses immunogénomiques avec interprétation cliniquement pertinente • Application de méthodes de machine learning / IA aux données omiques, avec un accent sur la robustesse et l'interprétabilité • Traduction de nouvelles méthodes en diagnostic de routine, y compris la documentation et la validation • Préparation de rapports cliniques en collaboration avec des pathologistes et des biologistes moléculaires • Soutien à la formation du personnel médical et de laboratoire dans l'interprétation des données et les flux de travail bioinformatiques <br /> Votre profil <br /> • MSc ou PhD en bioinformatique, biologie computationnelle, informatique médicale ou un domaine connexe • Solide expérience dans l'analyse de données NGS/omiques dans un cadre appliqué • Maîtrise de Python et/ou R (Bioconductor) • Excellente compréhension de la biologie moléculaire et de la génétique, avec la capacité d'interpréter les données dans un contexte biologique et clinique • Solide compréhension des statistiques et du machine learning • Expérience avec les systèmes de gestion de workflow (Nextflow, Snakemake) et la conteneurisation (Docker/Singularity) • Excellentes capacités d'analyse, de communication et de rédaction • Anglais requis, l'allemand est un avantage Qualifications préférées : expérience en génomique du cancer, immunogénomique, transcriptomique ou épigénétique, métagénomique, analyse d'images basée sur l'IA, gestion des données/reporting structuré, multi-omique intégrative, ou travail dans un environnement clinique/médical <br /> Informations complémentaires Pour plus d'informations, veuillez contacter Dr. Dr. Bettina Sobottka (annabettina.sobottka-brillout@usz.ch) ou PD Dr. med. Jan Hendrick Rüschoff (JanHendrik.Rueschoff@usz.ch). Nous nous réjouissons de recevoir votre candidature Daniel Buschor Recruiting Für diese Stelle können keine Dossiers von Personalvermittlern berücksichtigt werden. Danke für Ihr Verständnis. Unsere Benefits benefit1,benefit2,benefit3,benefit4,benefit5,benefit6,benefit7,benefit8 Über das USZ Das Universitätsspital Zürich ist eines der grössten Spitäler in der Schweiz. Unsere über 8'600 Mitarbeitenden und rund 700 Auszubildende setzen sich täglich für das Wohl unserer Patient:innen ein.