Bioinformaticien (m/f) 80-100% - au sein d'équipes de recherche translationnelle en cancer pédiatrique

au sein d'équipes de recherche translationnelle en cancer pédiatrique Vos responsabilités • En tant que partenaire computationnel clé au sein d'un environnement de recherche collaboratif, vous apporterez votre expertise en bioinformatique à travers les groupes de recherche, en développant des flux de travail d'analyse reproductibles, en intégrant divers ensembles de données omiques et en traduisant des données complexes en informations biologiques significatives. • Dans ce rôle, l'analyse de données de séquençage à haut débit (WGS, WES, RNA-seq, single-cell RNA-seq et ATAC-seq), ainsi que des ensembles de données métabolomiques et protéomiques, sera une responsabilité centrale. • Votre expertise sera essentielle pour développer, optimiser et maintenir des pipelines computationnels robustes et reproductibles pour le variant calling, l'analyse de l'expression différentielle et les flux de travail bioinformatiques connexes. • Un aspect clé de votre travail sera l'intégration d'ensembles de données génomiques publiques sur le cancer avec des données expérimentales internes et externes afin de soutenir des projets de recherche innovants. • En travaillant en étroite collaboration avec des chercheurs de diverses disciplines, vous fournirez un support statistique, créerez des visualisations de données pertinentes et contribuerez à l'interprétation biologique de jeux de données complexes. • En soutenant l'infrastructure computationnelle du laboratoire, vous maintiendrez les répertoires de code, améliorerez la documentation des flux de travail et assurerez une gestion efficace du stockage des données. • Vos contributions s'étendront à la préparation de manuscrits scientifiques, de demandes de subventions et de rapports d'avancement de la recherche. Votre profil • Comment postuler : Soumettez un seul PDF contenant une lettre de motivation (max 2 pages), votre CV, la liste de vos publications et les coordonnées de deux références • Diplôme : Master ou doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, informatique ou dans un domaine analytique connexe • Programmation & computing : Maîtrise de Python ou R, du scripting shell (Bash) dans un environnement Linux/Unix, et expérience de travail avec le calcul de haute performance (HPC) ou les environnements cloud (AWS/GCP) • NGS & workflows : Expérience avérée dans l'analyse de données de séquençage de nouvelle génération (NGS) (une expérience en analyse single-cell est un plus) et familiarité avec les systèmes de gestion de workflow tels que Nextflow et Snakemake • Langue : Excellentes compétences en communication écrite et orale en anglais • Domaine : Antécédents de recherche préalables en hémato-oncologie, immunologie ou métabolisme du cancer • Single-cell : Expérience pratique de l'analyse de données multi-omiques single-cell (Seurat, Scanpy) • Spectrométrie de masse : Expérience dans l'analyse de données métabolomiques ou lipidomiques • Statistiques : Solides bases en biostatistique et en applications d'apprentissage automatique (machine learning) en oncologie Votre salaire ## Le salaire exact dépendra de vos qualifications et de votre expérience professionnelle. Votre salaire sera établi conformément à nos directives salariales lors du processus de sélection. Les candidats ne possédant pas encore les compétences et l'expérience nécessaires pourront, dans certains cas, se voir proposer une échelle de rémunération inférieure. Dans de nombreux cas, une rémunération supplémentaire sera offerte pour les horaires de travail irréguliers. L'évolution ultérieure du salaire dépendra de vos performances et de la capacité financière de l'Eleonorenstiftung. show more Show less Contact ### Leal Oburoglu, Ph.D. Research Assistant Onkologie Yigit Baskan HR Business Partner \+41 44 249 23 03 Apply now Votre début avec nous Prêt à avoir un impact ? Nous nous réjouissons de recevoir votre candidature. Votre lieu ### Lenggstrasse 30 8008 Zürich Open Google Maps Steinwiesstrasse 75, 8032 Zürich