Data scientist in diagnostic molecular pathology 80-100%

L'unità di Molecular Pathology presso il Department of Pathology and Molecular Pathology dell'University Hospital Zurich è un'unità leader per gli sviluppi nella medicina di precisione, inclusi la genomica tumorale e l'integrazione di dati multi-omici. Le analisi diagnostiche includono numerosi moderni metodi omici e tecnologie all'avanguardia: Whole genome sequencing, bulk RNA sequencing, methylation array, digital pathology, panel sequencing. I nostri scienziati analizzano i dati grezzi di questi test per creare report diagnostici, sviluppare nuovi metodi e supportare progetti di ricerca. I vostri compiti principali <br /> • Analisi indipendente, controllo di qualità e interpretazione di dati NGS e multi-omici in un contesto diagnostico • Sviluppo, validazione e implementazione di pipeline bioinformatiche per la diagnostica molecolare di routine • Analisi immunogenomiche con interpretazione clinicamente rilevante • Applicazione di metodi di machine learning / AI ai dati omici, con enfasi su robustezza e interpretabilità • Traduzione di nuovi metodi nella diagnostica di routine, inclusi documentazione e validazione • Preparazione di report clinici in collaborazione con patologi e biologi molecolari • Supporto nella formazione del personale medico e di laboratorio nell'interpretazione dei dati e nei workflow bioinformatici <br /> Il vostro profilo <br /> • MSc o PhD in Bioinformatics, Computational Biology, Medical Informatics o un campo correlato • Forte esperienza nell'analisi di dati NGS/omici in un contesto applicato • Competenza in Python e/o R (Bioconductor) • Forte comprensione della biologia molecolare e della genetica, con la capacità di interpretare i dati in un contesto biologico e clinico • Solida comprensione della statistica e del machine learning • Esperienza con sistemi di gestione del workflow (Nextflow, Snakemake) e containerizzazione (Docker/Singularity) • Eccellenti capacità analitiche, comunicative e di scrittura • Inglese richiesto, il tedesco è un vantaggio Qualifiche preferibili: esperienza in cancer genomics, immunogenomics, transcriptomics o epigenetics, metagenomics, AI-based image analysis, data management/structured reporting, integrative multi-omics, o lavoro in un ambiente clinico/medico <br /> Ulteriori informazioni Per ulteriori informazioni, si prega di contattare Dr. Dr. Bettina Sobottka (annabettina.sobottka-brillout@usz.ch) o PD Dr. med. Jan Hendrick Rüschoff (JanHendrik.Rueschoff@usz.ch). Non vediamo l'ora di ricevere la vostra candidatura Daniel Buschor Recruiting Für diese Stelle können keine Dossiers von Personalvermittlern berücksichtigt werden. Danke für Ihr Verständnis. Unsere Benefits benefit1,benefit2,benefit3,benefit4,benefit5,benefit6,benefit7,benefit8 Über das USZ Das Universitätsspital Zürich ist eines der grössten Spitäler in der Schweiz. Unsere über 8'600 Mitarbeitenden und rund 700 Auszubildende setzen sich täglich für das Wohl unserer Patient:innen ein.