Laboratory Manager

Laboratory Manager # 100%, Basel, durée déterminée #### print Drucken  Le Quake Laboratory est en cours d'établissement à l'ETH Zürich en 2026 par Stephen Quake, qui quitte l'Université de Stanford. Le laboratoire travaille à l'interface de la physique, de l'ingénierie et de la biologie, en développant de nouvelles approches de mesure et de modélisation qui transforment ce qu'il est possible d'apprendre des cellules individuelles et de quantités infimes de matériel moléculaire. Trois grands programmes de recherche fonctionneront en parallèle : (1) la reconstruction de l'architecture réglementaire d'E. coli à haute résolution comme base pour des modèles prédictifs de la régulation génique ; (2) la création d'atlas de cellules uniques à grande échelle de tissus humains et d'organismes modèles - incluant un premier du genre atlas du système nerveux autonome humain - et l'entraînement de modèles d'IA/fondation sur ces atlas pour interroger la biologie du vieillissement et l'évolution de la multicellularité ; et (3) l'avancement des approches de biopsie liquide qui lisent les acides nucléiques libres de cellules à partir du sang pour détecter des maladies et surveiller la physiologie en collaboration avec des partenaires externes. Le laboratoire sera un environnement multidisciplinaire d'environ 10 personnes comprenant des biologistes moléculaires, des biochimistes, des biologistes computationnels, des chercheurs en apprentissage automatique, des physiciens et des ingénieurs, avec des collaborations actives à travers l'ETH, l'EPFL, l'Université de Zürich et à l'international. Contexte du projet ## Le Laboratory Manager est la colonne vertébrale opérationnelle du groupe. Vous serez responsable du fonctionnement quotidien d'un laboratoire humide complexe et multimodal - de la biologie moléculaire bactérienne au traitement d'échantillons cliniques humains en passant par le séquençage à haut débit - tout en servant de chercheur principal de paillasse, de formateur et de conseiller de confiance auprès du PI pour tout ce qui permet à un groupe de recherche productif de fonctionner. Ce rôle est idéal pour un chercheur expérimenté qui apprécie travailler sur plusieurs systèmes biologiques, construire des infrastructures, encadrer des collègues moins expérimentés et s'enorgueillir de l'excellence opérationnelle. On ne s'attendra pas à ce que vous dirigiez un programme de recherche indépendant distinct ; au contraire, vous permettrez et accélérerez celui de tous les autres. En retour, vous serez un contributeur clé, nommé, sur une science ambitieuse, avec une voix véritable sur la manière dont le laboratoire est construit. Description du poste ## Opérations et infrastructure du laboratoire • Diriger le développement et l'exploitation continue des installations de paillasse humide du laboratoire à l'ETH, y compris la sélection de l'équipement, l'installation, la qualification et les contrats de maintenance de routine • Établir et maintenir des ressources partagées : salles de culture cellulaire, zones BSL-2, zones de préparation au séquençage, stockage à -80 °C et à l'azote liquide, autoclaves, stocks de réactifs communs et calendriers des instruments • Assumer la responsabilité des commandes, des relations avec les fournisseurs, de la gestion des stocks et de l'organisation du magasin pour les consommables et les réactifs ; négocier des accords-cadres si nécessaire • Maintenir et auditer les SOP de base, les systèmes de suivi des échantillons et les pratiques de cahier de laboratoire électronique à travers le groupe • Servir d'interface du laboratoire avec les installations centrales de l'ETH (par ex., Functional Genomics Center Zurich, ScopeM, Genome Engineering & Measurement Lab) et les prestataires de services externes Biologie moléculaire bactérienne et biochimie - régulome d'E. coli • Gérer et superviser un pipeline de clonage moléculaire pour E. coli - conception et assemblage de plasmides et de constructions intégrées au génome, construction de souches et stockage • Mettre en place et maintenir des flux de travail biochimiques pertinents pour les études réglementaires : expression et purification de protéines, transcription in vitro et biochimie quantitative selon les besoins des projets • Établir une infrastructure de croissance microbienne, d'induction et de suivi temporel, incluant des lecteurs de plaques, des systèmes de culture continue et des interfaces de microfluidique le cas échéant • Former les nouveaux membres du laboratoire à la microbiologie fondamentale, aux techniques stériles et à la génétique standard d'E. coli ; résoudre les problèmes de projets de clonage et d'expression bloqués Mammalian cell biology et manipulation de tissus - atlas de cellules uniques • Gérer et superviser la culture de cellules de mammifères (cellules primaires, cellules dérivées d'iPSC, lignées établies), y compris la préparation de milieux, l'authentification des lignées et la bio-banque • Établir des flux de travail robustes pour la dissociation des tissus, la préparation de suspensions de cellules uniques et de noyaux uniques, le tri cellulaire par FACS et l'évaluation de la qualité • Coordonner le pipeline d'acquisition de tissus avec les partenaires cliniques et académiques - accords sur les spécimens biologiques, documentation de la chaîne de garde, logistique de fixation et d'expédition, manipulation d'échantillons approuvée par l'éthique Biopsie liquide et flux de travail d'acides nucléiques libres de cellules • Exploiter et maintenir des flux de travail d'extraction de cfDNA et cfRNA à faible apport • Implémenter et affiner les protocoles de préparation de bibliothèques cfNA (WGS à faible apport, méthylation/EM-seq, fragmentomique, panels ciblés, cfRNA-seq) et contribuer au développement de méthodes pour de nouvelles modalités de test • Établir des pratiques de gestion de la qualité appropriées aux échantillons de qualité clinique Séquençage à haut débit • Servir d'expert princ